Marek Safjan on syntynyt Varsovassa (Puola) vuonna 1949. Hän opiskeli Uniwersytet Warszawskissa (Varsovan yliopisto, Puola), jossa hän suoritti oikeustieteen tutkinnon vuonna 1971 ja väitteli oikeustieteen tohtoriksi vuonna 1980. Kyseinen yliopisto myönsi hänelle vuonna 1990 oikeustieteiden dosentin arvon, ja vuonna 1998 hänet nimitettiin oikeustieteiden professorin virkaan.

Safjan aloitti työuransa vuonna 1973 niin ikään Uniwersytet Warszawskissa opettaen oikeustiedettä siviilioikeuden instituutin assistenttina. Vuosina 1991–1998 hän toimi oikeustieteen professorina sekä siviilioikeuden instituutin johtajana. Hän oli yliopiston vararehtori vuosina 1994–1997.

Safjan on myötävaikuttanut aktiivisesti oikeustieteen alan tutkimukseen ja osallistunut useisiin tutkimuksiin siviili-, lääkintä- ja eurooppaoikeuden aloilla, ja hän toimi vuosina 1991–1997 Puolan edustajana Euroopan neuvoston bioetiikkakomiteassa ja henkilötietojen suojakomiteassa. Hänet nimitettiin Henri Capitant des Amis de la Culture Juridique Française ‑järjestön Puolan-osaston pääsihteeriksi vuosiksi 1994–1998.

Akateemisen toimintansa ohella Safjan on ollut Instytut Wymiaru Sprawiedliwościn (oikeus‑ ja tuomioistuininstituutti, Puola) johtaja vuosina 1992–1997.

Hän jatkoi uraansa tuomioistuinlaitoksessa Trybunał Konstytucyjnyssa (perustuslakituomioistuin, Puola), johon hänet nimitettiin vuonna 1997 tuomariksi ja jonka presidenttinä hän toimi vuosina 1998–2006.

Unionin tuomioistuimen tuomari 7.10.2009–31.1.2024.